Awalnya Museum Fatahilah yang memiliki luas 1.300 m² berfungsi sebagai kantor pusat administratif perusahaan Hindia Timur Belanda yang dibangun pada tahun 1707. Memiliki koleksi sekitar 23.500 benda, Museum Fatahilah memiliki benda-benda koleksi dari perusahaan Hindia Timur Belanda, perabotan bergaya Betawi, peta abad ke 16, replika Prasasti Tugu dan juga replika monumen Padrao 1522.